Na poliomielite há necrose extensa de neurônios do corno anterior da medula  espinal podendo chegar à cavitação. Há infiltrado linfomonocitário perivascular intenso no parênquima, como é o caso também em outras encefalites virais. O quadro histológico é inespecífico e na pólio geralmente não há inclusões virais como as demonstradas acima. Contudo, a localização das lesões no corno anterior é característica  (ver lâmina da coleção didática, A. 342). 

As lesões histológicas da encefalite herpética são típicas das encefalites virais em geral e inespecíficas não permitindo por si sós o diagnóstico do agente. Destacam-se porém pela gravidade. O acometimento vascular é responsável em parte pela necrose, de expressão já macroscópica. 

A neuronofagia é uma feição própria das encefalites e não ocorre, por exemplo, em necrose isquêmica.  Decorre de atração de células imunocompetentes pelos antígenos virais presentes na superfície externa dos neurônios parasitados.